در متن حکم انتصاب دکتر محمدعلی زلفی‌گل خطاب به سرپرست پژوهشگاه ملی اقیانوس شناسی و علوم جوّی آمده است؛ "نظر به مراتب تعهد، تخصص و تجارب ارزشمند جنابعالی، و بنا بر پیشنهاد معاون محترم پژوهشی به موجب این حکم به سمت «سرپرست پژوهشگاه ملی اقیانوس شناسی وعلوم جوّی» منصوب می‌شوید.
انتظار می‌رود با پیروی از آموزه‌های اسلامی، مبانی علمی و روحیه انقلابی و راهبردهای اساسی دولت مردمی و جلب همکاری استادان، پژوهشگران، مدیران و کارکنان (یاوران علمی) گرامی، نقشی شایسته در تحقق اهداف نظام آموزش عالی ایفا نمائید.
امید است که با توکل به خداوند متعال، مأموریت‌ها و وظایف آن پژوهشگاه را به شرح ذیل به انجام برسانید:

طراحی واجرای برنامه‌های مشترک پژوهشی و فناوری و پروژه‌های بزرگ ملی و فراملی در زمینه اقیانوس شناسی وعلوم جوّی
ایجاد ارتباط علمی، پژوهشی و آموزش‌ های کاربردی با مراکز بین المللی و شبکه‌های جهانی در زمینه اقیانوس شناسی و علوم جوّی
بسترسازی جهت استفاده از فناوری‌های نوین در زمینه‌های مختلف اقیانوس شناسی و علوم جوّی
کوشش در جهت کاربردی نمودن هر چه بیشتر پژوهش‌های انجام شده در زمینه اقیانوس شناسی و علوم جوّی
تعیین اولویت‌های علمی، تحقیقاتی، فناوری و نوآوری در حوزه علوم جوّی
تلاش در جهت کسب مرجعیت و دیپلماسی علمی در حوزه‌های مأموریتی ذیربط
برجسته‌سازی نقش علوم جوی در نظام ملی نوآوری
هدایت، حمایت وراهبری پژوهشگران ومتخصصان حوزه‌های مأموریتی
تلاش در جهت دستیابی به افق‌های آینده علم، فناوری ونوآوری در علوم جوّی
تهیه برنامه راهبردی پنج ساله برای پژوهش‌های هدفمند در حوزه‌های علوم جوّی واقیانوس شناسی
تهیه نقشه دانش جوّی کشور، نیاز سنجی ونیاز آفرینی در حوزه‌های مأموریتی

توفیق روزافزون جنابعالی را در پیش‌برد اهداف متعالی نظام مقدس جمهوری اسلامی ایران و منویات رهبر حکیم انقلاب اسلامی، حضرت آیت الله خامنه‌ای (مدظله العالی)، از درگاه پروردگار متعال خواستارم."
وزیر علوم، تحقیقات و فناوری ههمچنین در نامه جداگانه‌ای از خدمات و تلاش‌های دکتر بهروز ابطحی رئیس سابق پژوهشگاه ملی اقیانوس‌شناسی و علوم جوّی در مدت تصدی این مسئولیت قدردانی کرد.
گفتنی است دکتر مرتضی توکلی (زاده شازند استان مرکزی -۱۳۵۲) عضو هیات علمی با مرتبه دانشیاری گروه جغرافیای دانشگاه تربیت مدرس است که سوابق اجرایی همچون مدیر گروه، مدیر کتابخانه مرکزی و مرکز اسناد، مدیر امور دانشجویی، مدیر دفتر همکاریهای علمی بین المللی، معاون پژوهشی دانشگاه و رئیس دانشگاه را در کارنامه خود دارد. وی همچنین ناظر سند بنیادی اقتصاد مقاومتی سازمان بسیج اساتید کشور و مدیر نشریات علمی پژوهشی آن سازمان را در سال ۹۷-۹۸ برعهده داشته است.